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Commentaire éditorial: Test microbiologique de la diarrhée post-transplantation d’organes

Voir l’article majeur par Echenique et al sur les pages -Jusqu’à% des receveurs de transplantation d’organes solides SOT expérience de diarrhée post-transplantation, avec certains épisodes étant suffisamment graves pour nécessiter une hospitalisation médicaments immunosuppresseurs sont une cause commune, mais la réduction de l’immunosuppression comporte le risque de rejet de l’allogreffe, ce qui nécessite d’écarter d’autres causes, comme l’infection, avant de modifier le régime immunosuppresseur Dans ce numéro de Clinical Infectious Diseases, Echenique et ses collègues rapportent fréquence des causes infectieuses et rendement diagnostique des tests microbiologiques dans une grande cohorte rétrospective de patients SOT hospitalisés présentant une diarrhée d’origine communautaire ou hospitalière Un objectif implicite de l’étude était de déterminer si une approche ciblée pour tester les causes infectieuses de la diarrhée pourrait être considéré comme une alternative aux stratégies d’essai plus complètes recommandées à t Etant donné cette question, il est frappant de constater que la plupart des épisodes diarrhéiques dans leur étude n’avaient pas d’étiologie spécifique identifiée, infectieuse ou autre, et étaient résolus à l’hôpital avant leur sortie. Une cause infectieuse potentielle a été identifiée dans En général, la plupart des infections étaient limitées à des agents – Clostridium difficile, norovirus ou cytomégalovirus – qui comprenaient>% des cas infectieux identifiés. Autres causes infectieuses de diarrhée, telles que Campylobacter, Salmonella, rotavirus, adénovirus, astrovirus, Cryptosporidium et Giardia, ont rarement été identifiés. À la lumière de ces résultats, les auteurs suggèrent que les tests initiaux des causes infectieuses de diarrhée chez les receveurs SOT pourraient être limités à quelques tests, par exemple, cytomégalovirus. réaction en chaîne [PCR], PCR en C difficile, transcription inverse de norovirus PCR, culture de selles bactériennes chez la plupart des patients Ensuite, si les symptômes persistent, des tests supplémentaires pourraient être effectués pour diagnostiquer ou exclure des causes infectieuses moins courantes avant de modifier les régimes immunosuppresseurs. Une approche analogue à plusieurs niveaux est utilisée depuis des décennies chez les patients immunocompétents atteints de diarrhée. Avant de généraliser les résultats de cette étude à d’autres centres Premièrement, les fréquences de plusieurs pathogènes potentiellement significatifs chez des hôtes immunocompromis, tels que Campylobacter et Cryptosporidium, étaient plus faibles dans cette étude que les études antérieures basées en Europe. Inversement, le taux de C difficile les épisodes diarrhéiques apparus dans la communauté étaient plus élevés que d’autres études et comparables au taux de C difficile dans les épisodes diarrhéiques à l’hôpital. Cette évolution peut être une manifestation de l’épidémiologie changeante du C difficile avec plus de transmission et d’infection dans la communauté ou simplement des symptômes après l’hospitalisation Alternativement, il est possible que certains des cas de C difficile identifiés dans les épisodes diarrhéiques apparus dans la communauté soient des infections récidivantes ou une colonisation persistante avec une autre cause de symptômes, car de nombreux patients avaient des antécédents d’infection à C. difficile. Par rapport aux centres de transplantation, les auteurs notent que les résultats de cette étude ne devraient pas être généralisés sans une vérification de l’épidémiologie locale. validation

fficile%%%%%% -% Campylobacter, Salmonella%%%%%% -% Virus CMV%%%% -%% -% NT Norovirus%% NT%%% -% Autres virus GI%%%%%% Parasites Cryptosporidium, Giardia &%;%%%%% Autres% – &%;%%%%% -% Étude Echenique, Ce numéro Maes et al, Roos-Weil et al, Coste et al, Méthodes de test Moléculaire et Classique Classique Moléculaire et Classique Multiplex Moléculaire Panneaux Pays États-Unis Belgique France France Population CO Diarrhée HO Diarrhée Diarrhée CO Diarrhée CO Diarrhée Non Diarrhée Type de Transplant Mixte Mixte Rénal Rénal Rénal Rénal Positif total%%%%% -%% -% de bactéries Clostridium difficile%%%%%% -% Campylobacter, Salmonella%%%%% -% virus CMV%%%% -%% -% NT Norovirus%% NT%%% -% Autres virus GI%% %%%% Parasites Cryptosporidium, Gia rdia & lt;%%%%%% Autres% – & lt;%%%%%% -% Abréviations: CMV, cytomégalovirus; CO, apparition dans la communauté; GI, gastro-intestinal; HO, début de l’hôpital; La plupart des épisodes diarrhéiques de cette étude comprenaient un bilan microbiologique abrégé en dépit d’un test institutionnel plus complet. protocole La culture de selles bactériennes a été réalisée dans seulement% des épisodes diarrhéiques apparus dans la communauté, et des tests de Cryptosporidium et Giardia ont été réalisés dans seulement% des épisodes, rendant possible l’absence de cas infectieux en raison du manque de tests. Ce n’est pas la faute des auteurs, car l’étude était un résumé rétrospectif de la pratique dans le monde réel et non une étude prospective conçue pour définir de manière exhaustive les étiologies infectieuses de la diarrhée chez les receveurs de SOT. Les stratégies de test observées dans cette étude peut également avoir été une pratique médicale raisonnable et rentable, car mo Les épisodes diarrhéiques semblent avoir une durée relativement courte Cependant, il est important d’être conscient du bilan limité des agents pathogènes intestinaux lors de l’interprétation des résultats de cette étude. Le dernier point à souligner est que les méthodes de diagnostic pour les agents pathogènes gastro-intestinaux sont rapides. Les panels d’essais d’amplification des acides nucléiques multipathogènes hautement sensibles sont en passe de devenir le test diagnostique de routine des agents pathogènes gastro-intestinaux dans les années à venir Deux panels d’essais moléculaires détectant chacun de multiples pathogènes diarrhéiques sont déjà approuvés pour des tests diagnostiques in vitro. Administration de médicaments Plusieurs autres panels de pathogènes gastro-intestinaux multiplex sont à divers stades d’essais cliniques et d’examen réglementaire. Comme dans le cas de l’introduction de panneaux respiratoires multiplex viraux, il est probable que ces panels de pathogènes gastro-intestinaux multiplex remplaceront des tests moins sensibles. De plus, que ce soit en termes de rentabilité ou non, ces panels moléculaires multiplexes peuvent éviter la nécessité ou le choix de cibler les tests sur des agents pathogènes sélectionnés. Des chercheurs en France ont récemment démontré le potentiel dramatique de ces panneaux. pour augmenter la détection des agents pathogènes gastro-intestinaux chez les receveurs SOT, les amenant à remettre en question le dogme que la diarrhée post-transplantation n’est pas infectieuse Dans cette étude pilote, les chercheurs ont testé les selles des épisodes de diarrhée sévère avec plusieurs agents pathogènes gastro-intestinaux. panneaux et résultats comparés avec les méthodes d’essai classiques, à savoir, culture, examens microscopiques, immunoessais, quelques tests moléculaires Fait frappant, la proportion d’échantillons avec ou plus de pathogènes détectés augmente de% avec les tests classiques à% après performance des panels de pathogènes gastro-intestinaux. Des résultats similaires ont été bee Cependant, il convient de noter que les patients transplantés asymptomatiques peuvent également avoir des agents pathogènes détectés par ces panels multiplex, ce qui rend essentiel de limiter les tests aux patients symptomatiques et de corréler cliniquement les résultats des tests . Cette étude utilisant des panels de pathogènes gastro-intestinaux multiplex est incluse dans les sixième et septième colonnes du tableau pour comparaison avec l’étude d’Echenique et al. et les études précédentes publiées ailleurs [, -] En résumé, Echenique et ses collègues fournissent des données précieuses La mise en œuvre clinique de panels d’essais de pathogènes gastro-intestinaux multiplexes est susceptible d’augmenter la proportion de patients diarrhéiques avec un pathogène potentiel identifié, les causes infectieuses étant limitées à quelques pathogènes selon les méthodes d’essai existantes. changer la question de quels tests à l’ordre, à quand tester et quand traiter

Remarque

Conflit d’intérêts potentiel L’auteur certifie qu’il n’y a pas de conflit d’intérêts potentiel. L’auteur a soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit.