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Mortalité intra-hospitalière et extra-hospitalière associée à l’influenza saisonnière et pandémique et au virus respiratoire syncytial en Afrique du Sud, –

Les données sont limitées sur la contribution des décès extrahospitaliers à cette mortalitéMéthodesNous avons modélisé la surmortalité attribuable à la grippe et à l’infection par le RSV en appliquant des modèles de régression aux modèles de mortalité. Nous avons utilisé des modèles distincts pour les décès à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpitalRésultatsIl y avait des décès annuels moyens en Afrique du Sud, dont%% intervalle de confiance [IC]% -% survenus en dehors de l’hôpital Les taux de mortalité toutes causes confondues de la grippe saisonnière et du VRS étaient de% IC et% IC par population annuellement% [% IC% -%] et% [% IC% -%] de tous les décès respectivement. le taux de mortalité maximal était chez les personnes âgées de ≥ ans; % IC – pour la grippe et chez les nourrissons; % IC – pour le VRS Dans l’ensemble,%% IC% -% de la grippe saisonnière et%% IC% -% des décès associés au VRS survenus en dehors de l’hôpital Parmi les enfants âgés de & lt; années, les décès associés au VRS étaient plus susceptibles de survenir à l’hôpital, tandis que les décès associés à la grippe étaient plus susceptibles de survenir en dehors de l’hôpital ostéomalacie. Le taux de mortalité était le CI en% IC dans la première vague. deuxième vague en, avec%% CI% -% des décès associés à l’AHNpdm survenant en dehors de l’hôpitalDiscussionPlus de% des décès associés à la grippe saisonnière et au VRS se produisent en dehors de l’hôpital en Afrique du Sud Ces données suggèrent que les études peuvent considérablement sous-estimer le fardeau de la mortalité

Influenza, virus respiratoire syncytial, mortalité, enfants, Afrique du SudIl est important de quantifier la charge de mortalité liée au VRS du virus respiratoire et respiratoire syncytial afin de guider la priorisation des interventions. Données sur la mortalité associée à la grippe et au VRS. Le virus de l’immunodéficience humaine Le VIH est un facteur de risque important pour la mortalité associée à la grippe et au VRS en Afrique du Sud, avec une prévalence nationale du VIH de […] en Afrique du Sud a publié des estimations de la grippe. – et la mortalité associée au VRS, mais n’incluent pas les années suivant l’émergence mondiale de la grippe AHNpdm dans Facteurs qui pourraient avoir influé sur la mortalité associée à la grippe et au VRS en Afrique du Sud depuis les récentes améliorations dans la prévention et le traitement VIH et l’introduction du vaccin antipneumococcique conjugué dans le programme de vaccination de routine en En outre, le vaccin contre la grippe Près d’un million de doses distribuées annuellement Près de% des décès en Afrique du Sud se produisent en dehors de l’hôpital Il est important de comprendre la proportion de décès liés à la grippe et au VRS survenant en dehors de l’hôpital. interprétation des estimations mondiales et régionales de la mortalité associée à la grippe et au VRS Les décès hors hôpital seront omis dans les programmes traditionnels de surveillance de la grippe hospitalière, ce qui pourrait entraîner une sous-estimation du fardeau de mortalité associé à la grippe. les décès dans les hôpitaux peuvent fournir des multiplicateurs pour expliquer cette mortalité associée à l’influenza AHNpdm dans les groupes d’âge décrits dans les pandémies précédentes qui touchent principalement les personnes âgées de moins de 18 ans; années Dans certains milieux, la deuxième vague de grippe AHNpdm a été associée à un fardeau de mortalité plus important que la première vague On ne sait pas quelle était la charge de la deuxième vague de grippe AHNpdm en Afrique et si Nous avons cherché à estimer le taux de décès excessifs associés à la grippe et au VRS à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital en Afrique du Sud, selon le groupe d’âge. la surmortalité spécifique associée à la grippe AHNpdm et décrire le fardeau et la distribution par âge des décès entre les vagues pandémiques successives

Méthodes

Sources de données

Nous avons obtenu des données sur les causes sous-jacentes de décès et les dénominateurs démographiques de Statistics South Africa à Nous avons utilisé la Classification internationale des maladies, dixième révision CIM-codes pour compiler âge & lt ;, -, -, -, -, – , et ≥ années années série chronologique de mortalité pour toutes les causes ICD-: tout, tout-respiratoire ICD-: JJ, tout-circulatoire ICD-: II ainsi que la pneumonie et la grippe P & I ICD-: JJ; un sous-ensemble des décès par voies respiratoires Le lieu de décès est indiqué dans l’ensemble des données de l’état civil Nous avons obtenu les types et sous-types de virus grippaux et les données RSV de surveillance aiguë des maladies respiratoires sur les sites

Estimation de la mortalité associée au virus syncytial et influenzae respiratoire

Pour estimer la mortalité par type de virus / sous-type et par RSV, nous avons ajusté les modèles de régression par âge au taux de mortalité hebdomadaire en utilisant un modèle additif semiparamétrique généralisé. Nous avons inclus des variables indépendantes pour chaque type / sous-type et VRS pour chaque année Une spline de lissage cubique naturelle de semaines en tant que variable non paramétrique a été incluse. La spline comptabilise et ajuste le temps et la tendance de la mortalité non liée à la grippe dans le modèle Le nombre de nœuds a été sélectionné selon les critères d’Akaike. un meilleur ajustement pour la mortalité associée à la grippe par rapport aux approches de modélisation plus conventionnelles Le modèle est fourni ci-dessous: Taux d’émortalité = β βt [Σy = β, yInfluenza AHNpdm] [Σy = β, yInfluenza AHN] [Σy = β , yInfluenza B] [Σy = β, yRSV] splinetwhere taux d’Emortality est le taux de mortalité respiratoire prévu, t était le numéro de semaine séquentielle de la série chronologique hebdomadaire, Influenza AHNpdm est le p roxy pour influenza AHNpdm, influenza AHN est l’indicateur indirect de la grippe AHN, influenza B est l’indicateur de la grippe B, RSV est le proxy pour RSV, spline est la courbe spline pour t et est spécifié avec degrés de liberté, qui a atteint un degré de contrôle de l’autocorrélation & lt; Un degré de liberté est attribué à la variable de temps linéaire paramétrique βt et les degrés de liberté restants sont répartis par année pour la spline Le modèle corrèle les changements dans la détection de la grippe et du RSV aux changements du nombre de décès dans le temps. Des modèles séparés ont été ajustés pour chaque groupe d’âge et chaque cause de décès Nous avons estimé la surmortalité spécifique à l’âge associée aux types / sous-types de virus grippaux et au VRS chaque semaine en soustrayant une base de référence attendue de la prédictions hebdomadaires de mortalité du modèle La valeur de référence a été obtenue en fixant les covariables virales pertinentes, c.-à-d., pour obtenir une référence pour la grippe, nous avons fixé la variable saisonnière de la grippe pour chaque type / sous-type. mortalité pour chaque année Les estimations négatives n’ont pas été fixées à zéro Pour l’estimation de la mortalité saisonnière associée à la grippe En tant que validation, nous avons estimé la surmortalité associée aux décès par cancer CIM-CC, qui ne devraient pas varier avec la circulation de la grippe et du VRS Pour l’estimation du nombre de décès associés à la grippe saisonnière. – et la mortalité extrahospitalière, nous avons utilisé des modèles distincts de mortalité par décès et par décès en fonction de l’âge et de la cause de décès, tels qu’ils sont consignés dans les données statistiques vitales. Nous avons limité l’analyse hospitalière et extrahospitalière. décès aux grands groupes de toutes causes confondues, circulatoires et tous respiratoires parce que nous avons estimé qu’un code de pneumonie et de grippe de la CIM spécifique n’était pas fiable pour les décès hors de l’hôpital Les données sur le lieu de décès manquaient pour% Nous avons rajusté les estimations de la surmortalité finale pour tenir compte des données manquantes, en supposant que le pourcentage de décès à l’hôpital et à l’extérieur de l’hôpital était semblable chez les personnes dont les données manquaient. avec les données disponiblesNous avons obtenu l’intervalle de confiance en% pour la surmortalité estimée en utilisant le rééchantillonnage bootstrap sur les blocs d’années calendaires sur les réplications Pour chaque ensemble de données rééchantillonné nous avons réajusté le modèle de régression et le% IC mortalité estimée liée à la grippe et au VRS à partir des ensembles de données rééchantillonnés L’analyse statistique a été mise en œuvre à l’aide de la version STATA StataCorp, College Station, Texas

Éthique

Étant donné que cette analyse n’utilisait que des données sur la mortalité accessibles au public et des données de laboratoire désidentifiées et agrégées, l’étude a été considérée comme exempte de l’examen des sujets humains.

RÉSULTATS

Décès et taux de mortalité

La population de l’Afrique du Sud a augmenté de à dans, avec environ% des personnes âgées & lt; ans et% âgés ≥ ans À partir de, une moyenne des décès est survenue annuellement, dont% étaient attribuables aux causes respiratoires et% aux causes circulatoires. Tableau supplémentaire Le taux de mortalité annuel moyen par décès toutes causes confondues était plus élevé chez les personnes âgées ≥ années, et & lt; Les taux de décès toutes causes confondus par population ont baissé de% en moins en% Les réductions les plus importantes ont été observées chez les individus âgés de – ans% et & lt; année% et la plus petite chez les personnes âgées de ≥ ans%% de décès selon les saisons chaque hiver Figure supplémentaire

Surveillance de la grippe et du virus respiratoire syncytial

Une moyenne des échantillons de l’aire de répartition ont été testés pour la grippe et le VRS chaque année avec une moyenne annuelle de% d’intervalle de confiance CI% -% et%% CI% -% test positif pour la grippe et le VRS respectivement. En juin, le virus de l’influenza aviaire a atteint son apogée en juin, suivi de la grippe AHNpdm, qui a culminé en août. L’activité maximale de la VRS a été observée entre mars et mai

Figure Vue largeTélécharger la diapositiveA, Taux de détection c.-à-d. Nombre hebdomadaire d’échantillons positifs divisé par le nombre annuel d’échantillons testés par type / sous-type et virus respiratoire syncytial tous âges, Programme de SARI, Afrique du Sud, – B, Nombre de décès à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital par année et par semaine, enfants âgés de moins de 18 ans; ans, Afrique du Sud, – C, Nombre de décès à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital par année et par semaine, individus âgés ≥ ans, Afrique du Sud, -Figure View largeTélécharger slideA, Taux de détection, par semaine, nombre de spécimens positifs divisé par annuel Nombre de spécimens testés de la grippe par type / sous-type et virus respiratoire syncytial de tous âges, Programme SARI de Maladies Respiratoires Aiguës, Afrique du Sud, – B, Nombre de décès à l’hôpital et hors de l’hôpital par année et par semaine ; ans, Afrique du Sud, – C, Nombre de décès à l’hôpital et à l’extérieur de l’hôpital par année et par semaine, individus âgés de ≥ ans, Afrique du Sud, –

Décès liés à l’influenza saisonnière et au virus respiratoire syncytial

En ce qui concerne les décès toutes causes confondus associés à la grippe saisonnière, le taux de mortalité par population le plus élevé était chez les personnes âgées de ≥ ans; % IC: -, suivi des nourrissons; % IC: – Tableau, tableau supplémentaire, figure supplémentaire Pour les décès associés au VRS, le taux de mortalité maximal était chez les nourrissons; % IC: -, suivi des personnes âgées de ≥ ans; % IC: – La mortalité associée à l’influenza était la plus élevée pour la grippe AHN, suivie de la grippe AHNpdm et de la grippe B Tableau supplémentaire

Tableau Taux annuel moyen estimé des décès excédentaires associés au VRS et à la saison grippale par cause de décès et groupe d’âge en Afrique du Sud, – Cause du décès Groupe d’âge, années Toutes causes confondues, Ratea% CIb All-circulatoire, Ratea% CIb All- respiratoire, Ratea% CIb Pneumonie et grippe, Ratea% CIb RSV & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – ≥ – – – – Tous les âges – – – – Influenza & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – ≥ – – – – Tous les âges – – – – Cause du décès Groupe d’âge, années Toutes causes confondues, Ratea% CIb All-circulatoire, Ratea% CIb All-respiratoire, Ratea% CIb Pneumonie et grippe, Ratea% CIb RSV & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – ≥ – – – – Tous les âges – – – – Influenza & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – ≥ – – – – Tous les âges – – – – Abréviations: IC, intervalle de confiance; VRS, virus respiratoire syncytial Taux de dépression par intervalle de confiance de la personne-annéeb% estimés à l’aide du rééchantillonnage bootstrap sur les blocs d’années calendaires par rapport aux réplicationsVoir GrandLes taux de décès circulatoires associés à la grippe étaient plus élevés chez les personnes ≥; % IC: – Tableau Les taux de mortalité respiratoire associés à l’influenza étaient les plus élevés dans le groupe d’âge ≥ ≥ ans; % CI: -, suivi de & lt; an ; % CI: -, avec un profil similaire pour les décès P & I Similaire à la grippe, les taux de décès circulatoires associés au VRS étaient plus élevés chez les individus âgés ≥; IC: – Les décès respiratoires associés au VRS étaient les plus élevés chez les nourrissons; % IC: – et ≥ années; % CI: – groupes d’âge, avec un profil similaire pour les décès P & I. Un% et un% estimés de tous les décès respiratoires annuels étaient associés à la grippe et au VRS respectivement% et% chez les enfants âgés de & lt; ans pour la grippe et le VRS Tableau supplémentaire Nous n’avons pas estimé d’excès de décès par cancer significatifs associés à des données sur la grippe ou le VRS non montrées

Décès associés à la grippe AHNpdm

Nous avons estimé qu’il y avait% CI: – décès associés à la première vague de grippe AHNpdm en, IC%: – décès dans la deuxième vague en et% CI: – dans la première vague dans le tableau supplémentaire La proportion de décès dans les extrêmes de âge & lt; année et ≥ années passées de% en à% in et% in, avec des réductions concomitantes du pourcentage de décès chez les enfants plus âgés et les jeunes adultes Tableau, tableau supplémentaire, figure, figures supplémentaires – Les décès circulatoires représentaient% / de tous les décès en, % / in et% / in

Tableau Taux estimés de mortalité due à la grippe AHNpdm en Afrique du Sud en ondes st, onde et onde par groupe d’âge Rapport de mortalité proportionnelle vs% IC Cause du décès, groupe d’âge, années Ratea% CIb% b Ratea% CIc% b Ratea% CI c% b Toutes les causes & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous les âges – – – All-circulatory & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous les âges – – – All-respiratoire & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous âges – – – Pneumonie et grippe & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous âges – – – – Taux de mortalité proportionnelle vs% IC Cause du décès, groupe d’âge, années Ratea% CIb% b Ratea% Cci% b Ratea% CI c% b Toutes causes confondues & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous les âges – – – All-circulatory & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous les âges – – – All-respiratoire & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous âges – – – Pneumonie et grippe & lt; – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – & lt; – – – – – ≥ – – – – – Tous âges – – – – Abréviation: IC, intervalle de confiance a Taux de décès par année-personne bPourcentage de décès dans chaque groupe d’âge c% intervalles de confiance estimés à l’aide du rééchantillonnage bootstrap sur les tranches d’années civiles supérieures réplicationsView Large

Figure View largeTableau de téléchargementRatio de la proportion de décès associés à la grippe AHNpdm dans chaque groupe d’âge dans les vagues de la deuxième et de la troisième vague par rapport à la première vague * A, toutes causes confondues; B, tout-circulatoire; C, All-respiratoire; D, Pneumonie et influenza Proportion de mortalité = nombre de décès associés à la grippe AHNpdm dans le groupe d’âge i ou / total des décès associés à la grippe AHNpdm dans ou / nombre de décès associés à la grippe AHNpdm dans le groupe d’âge i / total grippe AHNpdm associés morts dans la figure Agrandir l’imageTableau de lectureRatio de la proportion de décès associés à la grippe AHNpdm dans chaque groupe d’âge dans les vagues de la deuxième et de la troisième vague par rapport à la première vague * A, toutes causes confondues; B, tout-circulatoire; C, All-respiratoire; D, Pneumonie et influenza Proportion de mortalité = nombre de décès associés à la grippe AHNpdm dans le groupe d’âge i ou / total des décès associés à la grippe AHNpdm dans ou / nombre de décès associés à la grippe AHNpdm dans le groupe d’âge i / total grippe AHNpdm associés décès en

Décès liés à l’influenza et au virus respiratoire syncytial associés à l’hôpital et à l’extérieur de l’hôpital

Dans l’ensemble,%% IC:% -% des décès toutes causes confondues,% IC%:% -% des décès circulatoires et% IC: – des décès respiratoires survenus hors de l’hôpital Tableau, tableau supplémentaire chez les enfants âgés de & lt; Le nombre de décès à l’hôpital a atteint un sommet entre les semaines et janvier et mai, coïncidant avec la période de circulation du VRS, alors que les décès hors hôpital ont atteint des sommets entre mai et juillet, coïncidant avec le pic de circulation du virus grippal. ≥ années, le moment du pic des décès à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital était similaire et coïncidait avec la période de circulation du virus de la grippe. Figure C

Tableau Estimations de la mortalité associée aux Influenzas et au VRS survenant à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital en Afrique du Sud, – Cause du décès Groupe d’âge, années% de décès en dehors de l’hôpital Ratio du% des décès dus à l’agent pathogène -hospital vs tous les décès% Cic Tous les VRS Influenza HNpdmb VRS Influenza a HNpdm b All-causes Tous les âges – – – – – – – & lt; – – – – – – – ≥ – – – – – – – Tout-circulatoire Tous les âges – – – Non estimé – – Non estimé & lt; – – – Non estimé – – Non estimé ≥ – – – Non estimé – – Non estimé All-respiratoire Tous âges – – – – – – – & lt; – – – – – – – ≥ – – – – – – – Cause de décès Groupe d’âge, années% de décès hors de l’hôpital Ratio du% de décès dus à un agent pathogène hors de l’hôpital par rapport à l’ensemble des décès% CIc Tous RSV Influenza HNpdmb RSV Influenza a HNpdm b Toutes causes confondues Tous âges – – – – – – – & lt; – – – – – – – ≥ – – – – – – – Tout-circulatoire Tous les âges – – – Non estimé – – Non estimé & lt; – – – Non estimé – – Non estimé ≥ – – – Non estimé – – Non estimé All-respiratoire Tous âges – – – – – – – & lt; – – – – – – – ≥ – – – – – – – Abréviations: CI, intervalle de confiance; VRS, virus respiratoire syncytial aPensée saisonnière en pandémieRatio du pourcentage de décès hors hôpital associés à la grippe à tous les décès exemple de décès toutes causes confondues = nombre de décès toutes causes confondues associés à la grippe hors hôpital / total associé à la grippe décès toutes causes confondues / nombre de décès toutes causes confondues hors de l’hôpital / nombre total de décès toutes causes confonduesVoir GrandNiveau global,% IC%:% -% des cas associés au VRS et% IC:% -% des cas associés à la grippe Parce que les décès sont survenus à l’extérieur de l’hôpital Tableau Pour les décès associés au VRS, proportionnellement moins de décès sont survenus hors de l’hôpital, comparativement au pourcentage global des décès toutes causes confondus en dehors de l’hôpital. groupe d’âge ans; par exemple,%% IC: – des décès toutes causes confondus associés au VRS se sont déclarés en dehors de l’hôpital vs%% IC:% -% du taux de risque global de décès toutes causes confondues RR; % IC: – En revanche, dans le groupe d’âge ≥ ans, plus ou une proportion similaire de décès associés au VRS se sont produits hors de l’hôpital par rapport à tous les décès pour toutes causes confondues% IC:% -% des décès associés au VRS -of-hôpital vs%% IC:% -% de tous les décès RR; % IC: – Pour les décès associés à la grippe saisonnière, le pourcentage de décès hors de l’hôpital était supérieur ou similaire au pourcentage global des décès hors de l’hôpital pour toutes les causes de décès et les groupes d’âge. grippe AHNpdm chez, pour les groupes toutes causes confondues, proportionnellement moins de décès survenus en dehors de l’hôpital

DISCUSSION

Ces changements dans la répartition des âges ont été décrits dans d’autres contextes et ont probablement contribué à la mortalité plus élevée dans les deuxième et troisième vagues. Les raisons postulées du changement dans la répartition par âge incluent l’immunité croissante chez les jeunes et la dérive progressive du virus. Le moment de la première vague à la fin de la saison grippale en mai a également contribué à une durée épidémique plus courte cette année. Pour estimer pleinement l’impact de la première vague de pandémie, les années de vie perdues pourraient être une mesure plus robuste Nous estimons qu’en Afrique du Sud, plus de la moitié des décès associés à la grippe et au VRS se produisent hors de l’hôpital. Fait frappant, parmi les enfants âgés de & lt; années, il y avait une différence dans la localisation des décès associés à la grippe et au VRS avec des décès associés au VRS survenant principalement à l’hôpital et des décès associés à la grippe survenant principalement à l’extérieur de l’hôpital. & lt; mois, alors que la grippe est plus fréquente chez les enfants légèrement plus âgés Les très jeunes enfants peuvent être plus susceptibles d’être hospitalisés et d’être admis à l’hôpital. années avec maladie respiratoire en Afrique du Sud, environ% test positif pour le VRS et% test positif pour la grippe En revanche, nos estimations de la mortalité respiratoire chez les enfants âgés de & lt; les années étaient relativement similaires pour le VRS; % IC: – et la grippe; % IC: – Bien qu’un taux élevé de létalité à l’hôpital comparé au VRS puisse partiellement expliquer cette différence, le fardeau substantiel de la mortalité associée à l’influenza hors de l’hôpital peut être un facteur contributif important Dans une étude Au Canada, avec% de couverture vaccinale contre la grippe chez les personnes âgées vivant dans la communauté,% des décès associés à la grippe, principalement chez les personnes âgées, ont eu lieu à l’extérieur de l’hôpital, avec% des décès chez les personnes âgées. années passées à l’extérieur de l’hôpital Une forte proportion d’individus décédant de la grippe souffraient d’une maladie pulmonaire ou cardiaque sous-jacente et une mort subite due à un événement cardiaque pourrait survenir plus souvent hors de l’hôpital. Les patients peuvent être moins susceptibles d’être admis pendant la saison de pointe de la grippe, car les installations peuvent être pleines. Dans la première vague de la pandémie, nous avons observé les décès associés à la grippe AHNpdm étaient plus susceptibles de survenir à l’hôpital, contrairement à l’observation que les décès associés à la grippe saisonnière étaient plus probables en dehors de l’hôpital. Une sensibilisation accrue pendant la pandémie aurait pu conduire les patients à chercher des soins plus rapidement. Il n’y avait pas de données disponibles en Afrique du Sud sur la recherche de soins de santé ou les procédures hospitalières pendant la pandémie. Les études ont plusieurs limites Bien que nous ayons utilisé des approches de modélisation établies pour estimer la mortalité associée à la grippe et au VRS, les données sont écologiques et les individus n’ont pas été testés pour la grippe Environ% des décès ont été codés de façon non spécifique, et ce pourcentage est resté constant pendant la période d’étude Il n’y a pas de données disponibles sur la fiabilité de la classification des causes de décès. être plus probable pour les décès hors de l’hôpital parce que lorsque des décès surviennent dans des régions éloignées, un chef de tribu peut remplir le certificat de décès Pour cette raison, nous avons limité l’analyse des décès à l’intérieur et à l’extérieur à une cause importante de décès groupes tels que les décès respiratoires et circulatoires Toutes les causes de mortalité ne devraient pas être soumises à ce biais, et les tendances de la mortalité à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital étaient similaires pour les décès toutes causes confondues Les données hebdomadaires sur les causes de décès ne sont disponibles que depuis le début et limitent le nombre d’années de données disponibles pour l’inclusion. En Afrique du Sud, l’enregistrement des décès est supérieur à%, mais les estimations de l’exhaustivité ne sont pas disponibles pour les décès et les décès. Les intervalles de confiance ont été estimés en utilisant l’analyse bootstrap, et nous avons obtenu des intervalles de confiance larges pour certaines estimations, en particulier pour les groupes d’âge et les paramètres avec de petits nombres. L’influenza et le RSV provoquent une mortalité importante en Afrique du Sud. Le fardeau de la mortalité due à la grippe AHNpdm était plus important dans les deuxième et troisième vagues, accompagné d’un changement marqué dans la répartition par âge des décès. Ces résultats nous aideront à mieux comprendre le fardeau de la mortalité mondiale et régionale et la planification en cas de pandémie.

Données supplémentaires

Les documents supplémentaires sont disponibles sur Clinical Infectious Diseases en ligne. Les données fournies par les auteurs étant destinées au lecteur, les documents publiés ne sont pas copiés et relèvent de la seule responsabilité des auteurs. Les questions ou les commentaires doivent donc être adressés à l’auteur correspondant.

Remarques

Déni de responsabilité Les constatations et les conclusions de ce rapport sont celles des auteurs et ne représentent pas nécessairement la position officielle des Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis. Divulgation financière Étant donné que les données publiques ont été utilisées, aucun financement n’a été reçu pour ce travail. : Aucun conflit d’intérêts signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués