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Surveillance communautaire aux États-Unis des streptocoques du groupe A pharyngés pédiatriques résistants aux macrolides pendant les saisons des maladies respiratoires

Contexte: Au total, un pourcentage de streptocoques du groupe A pharyngés provenant d’enfants de Pittsburgh étaient résistants aux macrolides. Nous avons évalué la résistance aux macrolides, les gènes de résistance et les types d’emm parmi les GAS aux États-Unis. les enfants – ans pendant les saisons respiratoires la – saison, la saison et la saison, GAS ont été testés pour la résistance aux macrolides et ont subi le séquençage des gènes emm résistant aux macrolides ont été testés pour la résistance à la clindamycine, et les gènes de résistance ont été observé en% des isolats de la saison,% de la saison, et% de la saison P = Clindamycine résistance a été trouvée en% des isolats; les taux annuels de résistance à la clindamycine étaient stables P = Le génotype de résistance prédominant chaque année était MEF A% -%; Les hétérogénéités des sous-types d’emm, des gènes de résistance et de la résistance à la clindamycine étaient évidentes parmi les isolats résistants dans certains types d’emm’s. La variabilité géographique des taux de résistance était présente chaque année. Conclusions Le taux de résistance aux macrolides chez le pharynx GAS était de & lt;% et était stable au fil des saisons Cependant, les taux variaient d’un site à l’autre chaque année Il n’y avait aucune preuve de propagation d’un clone résistant spécifique, augmentation de la résistance à la clindamycine ou augmentation des CMI médianes d’érythromycine

Les streptocoques du groupe A sont universellement sensibles à la pénicilline, mais leur résistance aux macrolides est bien connue Aux États-Unis, le taux de résistance aux macrolides défini comme CMI érythromycine ⩾ μg / mL parmi les GAA a été faible, généralement <% , mais% de GAS provenant d'enfants fréquentant une seule école à Pittsburgh pendant - étaient résistants à l'érythromycine Plusieurs mécanismes distincts sont responsables de la résistance aux macrolides parmi les GAS La méthylation ribosomique cible est codée par les gènes erm A ou erm TR et la résistance erm B-médiation est soit constitutive ou inductible efflux de macrolide est codé par un gène mef, habituellement mef A dans le GAS Autres mécanismes de résistance moins communs, y compris les mutations dans l'ARN ribosomique bactérien, interfèrent avec la liaison macrolide Résistance à la clindamycine par des mutations erm ou ribosomales mais pas par mef et se produit seulement dans le GAS en novembre résistant aux macrolides, nous avons commencé la surveillance annuelle de l'épidémiologie moléculaire de SGA des enfants atteints de pharyngite aiguë dans des communautés dispersées aux États-Unis et au Canada Bien qu'il y ait eu une collecte systématique de SGA invasif , à notre connaissance, il n'y a pas eu d'acquisition systématique de SGA pharyngien à plusieurs sites américains. une occasion unique d'évaluer le SGA résistant aux macrolides aux États-Unis Nous rapportons ici les résultats d'études de sensibilité aux macrolides d'isolats presque américains récupérés au cours des premières années de surveillance du SGA

Méthodes

Les tests effectués par des cliniciens évaluant des enfants de la pharyngite ont révélé des tests rapides de détection des antigènes ou des tests de gorge, conformément à leur pratique habituelle. Un échantillon de frottis a été prélevé et conservé en double exemplaire. plaques de culture positives pour le SGA qui ont été sélectionnées pour être incluses dans cette étude par le coordinateur de l’étude et / ou le personnel de laboratoire de chaque site pendant les périodes précoce, moyenne et tardive de la saison respiratoire. Laboratoire du Children’s Memorial Hospital de Chicago chaque saison Les identifiants cliniques étaient limités à l’âge, au sexe et à la date d’acquisition. Antécédents cliniques, traitement antibiotique et exposition antérieure aux antibiotiques n’ont pas été fournis Les résultats de nos études de laboratoire n’étaient pas disponibles. à des patients spécifiques Les spécimens ont été collectés de novembre à mai , Décembre à mai et novembre à mai Cette étude a été considérée comme étant exemptée de la réglementation du Département américain de la santé et des services sociaux pour la protection des sujets humains code CFR [b] par l’Institutional Review Board du Children’s Memorial Confirmation hospitalière des échantillons d’écouvillonnage GAS de gorge ont été striés sur de la gélose trypticase soja avec% de plaques de TSA-SB de sang de mouton BBL; Les colonies β-hémolytiques de Becton Dickinson ont été repiquées sur gélose au sang à ° C dans de l’air ambiant et ont ensuite été confirmées comme GAS au moyen de réactifs de groupage PathoDX. Des aliquotes de produits de diagnostic ont été conservés dans du bouillon Todd-Hewitt et% de glycérol. Détermination de la résistance aux macrolides Les isolats GAS de l’année ont été décongelés et repoussés sur TSA-SB pour les tests de sensibilité. Isolats collectés au cours des années et ont été étudiés immédiatement après confirmation des tests de susceptibilité au SGA pour l’érythromycine et la clindamycine. TSA-SB La résistance aux macrolides a été définie comme une CMI d’érythromycine ⩾ μg / mL, conformément aux critères d’interprétation NCCLS. MS Les isolats résistants aux macrolides ont également été testés pour la résistance à la clindamycine MIC, ⩾ μg / mL. réalisée en utilisant un disque d’érythromycine -μg BBL et un disque de clindamycine -μg BBL mm d’intervalle pour évaluer la résistance inductible à la clindamycine Macrol Le gène de résistance a été identifié par PCR en utilisant des amorces spécifiques pour les déterminants de résistance connus mef A, erm A et erm B; Sigma-Genosys, comme décrit ailleurs Des amorces spécifiques ont été choisies pour chaque gène à partir de séquences correspondantes déposées dans Genbank en utilisant Oligo, version NBI Software ADN de souches précédemment identifiées contenant erm A, erm B, ou mef A a été inclus comme contrôle de qualité Les isolats résistants aux macrolides qui ont été testés négatifs pour ces gènes ont été examinés par PCR et l’analyse de la séquence d’ADN pour des mutations dans le gène R ribosomal ARN Rrl pour inclure des régions dans Ces mutations de résistance aux macrolides ont été décrites chez des streptocoques et d’autres espèces en utilisant des amorces rapportées par Shortridge et coll. emm Typing GAS ont été soumis au séquençage d’emm et détermination de sous-type au laboratoire d’épidémiologie moléculaire de Streptococcal. ; Atlanta, comme décrit ailleurs emm Les sous-types sont déterminés uniquement sur la base de la séquence -base codant pour les acides aminés N-terminaux déduits de la protéine M mature Toute modification de base par rapport à la souche de référence CDC M correspondante Par exemple, les sous-types emm et emm correspondent aux souches de référence CDC désignées par emm et emm, respectivement. Exemple d’étude Il y avait des isolats GAS vérifiés de l’année l, un total de l’année, et un total de l’année pour les enfants de l’étude sites et envoyés pour analyse Des isolats de quarante et un ans n’ont pas été récupérés après congélation; Des problèmes techniques ont empêché le génotypage emm des isolats de GAS sensibles aux macrolides, laissant un pourcentage de ceux-ci soumis à des tests de résistance aux macrolides et au génotypage emm. Un isolat résistant aux macrolides d’année en année est devenu Les données ont été analysées à l’aide d’Epi Info CDC et SPSS, version SPSS La statistique χ et le test exact de Fisher ont été utilisés pour les données catégoriques. L’analyse de variance à un facteur ANOVA a été utilisée pour comparer les âges moyens des patients par année d’étude, et les tests t de Student ont été utilisés pour comparer les âges des patients avec des isolats résistants aux macrolides et aux macrolides

Résultats

Population des patients Au total,% des patients étaient des hommes, allant de% en année à% en année. L’âge médian des patients était de plusieurs années; L’âge moyen était des années et ne différait pas selon l’année d’étude P =, par ANOVA Les âges moyens des patients avec des années GAS résistantes aux macrolides et ceux des années GAS sensibles aux macrolides étaient similaires P =, par test t de Student Les taux de résistance aux macrolides ne différaient pas selon les groupes d’âge -, -, – et – années dans toute année d’étude ou pour toute la période d’étude données non montrées Résistance aux macrolides Le taux de résistance aux macrolides était de% taux χ =; P = ou dans les CMI macrolides parmi le tableau GAS résistant, mais il y avait variation parmi les sous-types d’emm. Il n’y avait pas de différence dans les taux de résistance des isolats recueillis dans le premier et deuxième semestre de toute année P = pour l’année et P = pour l’année emm types, et étaient les seuls types communs avec des taux cumulatifs de résistance aux macrolides & gt;% table Ces types représentaient% de susceptibilité et% de résistance GAS χ =; P & lt; Cinq autres types d’emm, emm,,,, et chacun avaient des taux élevés de résistance aux macrolides, mais étaient rares

Table View largeTélécharger les taux de résistance au méthrolide et les CMI pour les isolats résistants aux macrolides par année d’étudeTable Agrandir la photoTarifs de résistance au macrolide et CMI pour les isolats résistants aux macrolides par année d’étude

Tableau View largeTélécharger la lameMacrolide chez les streptococcies du groupe ATable View largeTélécharger la diapositive Résistance aux antibiotiques chez les types streptococciques du groupe A Les types les plus fréquents-emm, et -compris% de tous les isolats, mais chacun de ces types avaient une faible résistance taux, et ensemble, ils représentaient% de tous les isolats résistants tableau quatre emm types-emm, et et -ad les taux de résistance aux macrolides supérieure au taux global de%, avec emm et dépassant% Ces types représentaient% de GAS résistant aux macrolides et seulement% de GAZ sensible aux macrolides χ =; P & lt; Les isolats résistants aux macrolides restants ont été répartis entre les types de types Em-Ans-emm Taux de résistance aux macrolides pour les types les plus prévalents-emm, et -et-% Tableau Ces types comprenaient% de tous les isolats et% de ceux qui étaient résistants aux macrolides. types relativement communs, emm, et avaient des taux sensiblement supérieurs au taux annuel global de% et représentaient% d’isolats résistants et% d’isolats sensibles χ =; P & lt; Huit autres types d’emménagements comprenaient les types GASYear-emm résistants aux macrolides restants. Le type d’emm-emm le plus répandu présentait un taux de résistance macrolide% beaucoup plus élevé que dans le tableau des saisons précédentes. dépassait le taux global de% Ces types représentaient% des isolats résistants et% des isolats de type emm-typés sensibles χ =; P & lt; Les isolats résistants restants ont été répartis entre les types de résistance à la clindamycine. Le taux de résistance à la clindamycine était de% des isolats. La résistance à la clindamycine a été identifiée parmi les isolats résistants aux macrolides, isolats, isolats et isolats. isolats, isolats d’EM et isolats d’EMm En année, un total de% d’isolats étaient résistants à la clindamycine, la résistance constitutive était présente dans les isolats résistants aux macrolides, emm et emm et la résistance à la clindamycine inductible dans les isolats d’isolats emm, d’isolat, d’emm et d’emm isolat Le taux de résistance à la clindamycine en année était de% des isolats. Trois isolats résistants aux macrolides, dont tous constituaient une résistance constitutive, et la résistance était inductible. isolats, isolat et isolat d’emm. En outre,% de GAS résistant aux macrolides étaient également clindamycine Inductible résistant La prévalence de la résistance à la clindamycine était de% des isolats et ne variait pas selon l’année d’étude χ =; P = Génotypes de résistance aux macrolides Le génotype prédominant chaque année était mef A, variant de% à% des isolats résistants aux macrolides par an χ =; P = tableau En année, un isolat d’EMm résistante aux macrolides et sensible à la clindamycine d’érythromycine, μg / mL est devenu non viable et n’a pas été génotypé. Une résistance constitutive à la clindamycine était présente chez l’isolat erm A, l’isolat solitaire erm B emm et les deux isolats avec des mutations ribosomales emm et emm Une résistance inductible à la clindamycine a été démontrée dans les isolats de l’hermine em isolats emm, isolats emm et isolat emm

Tableau View largeTélécharger slideÉrythromycine Ery CMI parmi les isolats de streptocoques du groupe A résistants aux macrolides avec des génotypes définisTable View largeTélécharger la diapositive Erythromycine Ery CMI parmi les isolats de streptocoques du groupe A résistants aux macrolides avec des génotypes définisUne clindamycine-année sensible emm isoler érythromycine MIC, μg / mL non viable et n’a pas été génotypé Deux isolats erm B présentaient une résistance constitutive à la clindamycine emm [érythromycine MIC, μg / mL] et emm [érythromycine MIC, & gt; μg / mL], et un cas présentant une résistance inductible à la clindamycine présentait un gène erm B inhabituel [érythromycine MIC, μg / mL] Cinq isolats de l’hermine A exposés à la résistance à la clindamycine inductible isolats emm, isolat emm et isolat emm Tous les isolats résistants récupérés durant l’année ont été génotypés Le plus haut macrolide MIC & gt; La résistance à la clindamycine constitutive a été retrouvée dans l’isolat avec une mutation ribosomale et dans les isolats erm B, et une résistance inductible à la clindamycine a été trouvée dans l’isolat. Isolats isolats emm, isolat emm et isolat d’embryon Diversité génétique Il n’y avait aucune preuve de propagation d’un clone GAS résistant aux macrolides dominant dans un des tableaux de l’année En année, même au sein d’emm, qui comprenait% d’isolats résistants aux macrolides, sous-type, sous-type, sous-type, sous-type et sous-type et différents types de résistance. hétérogénéité du sous-type était évident parmi les macrolides-résistants dans les types d’emm emm type, type, type et type d’hétérogénéité des macrolides. et type La résistance à la clindamycine était également hétérogène dans certains types d’emm. Par exemple, parmi les isolats d’emm et les isolats d’emm, à la fois constitutifs et une résistance à la clindamycine inductible s’est produite; des isolats d’emm de l’année avec erm A présentaient une résistance inductible à la clindamycine et étaient sensibles à la clindamycine

DiapositiveDiversité des types d’emm et des génotypes de résistance aux macrolides chez les streptocoques du groupe A View largeTélécharger DiapositiveDiversité des types d’emm et des génotypes de résistance aux macrolides chez les streptocoques du groupe A. Variation géographique des taux de résistance aux macrolides Tableau des différences de taux de résistance aux macrolides sur les sites en Utah P =, par test de Fisher et l’Arkansas P =, par analyse The Les risques relatifs de résistance aux macrolides sur les sites de Floride et de l’Illinois étaient significativement plus élevés que ceux du Dakota du Sud; référence et Texas; P = pour les deux, Californie; P = pour les deux, et Connecticut; P = et P =, respectivement tableau Les différences dans les taux cumulatifs entre les autres sites n’étaient pas statistiquement significatives

Table View largeTélécharger les taux de résistance aux antibiotiques chez les streptocoques du groupe A, par stateTable Voir grandTélécharger les taux de résistance aux antibiotiques chez les streptocoques du groupe A, par état

Tableau View largeTélécharger la diapositive Risque relatif de résistance aux macrolides MR parmi les streptocoques du groupe A GAZ par stateTable View largeDownload slideRelatif risque de résistance aux macrolides MR parmi les streptocoques du groupe A GAZ par état

Discussion

Ainsi, Martin et al ont rapporté un taux beaucoup plus élevé de résistance à l’érythromycine chez les enfants pharyngés de Pittsburgh qui était entièrement dû à un clone emm isolé en Janvier Nous et d’autres avons démontré une hétérogénéité considérable parmi les types de GAS endémiques circulant dans les communautés [, -] L’hétérogénéité des types d’emm parmi les macrolides-résistants rapportés ici est compatible avec ces rapports et contraste avec les isolements clonaux emm à Pittsburgh L’expérience de Pittsburgh a probablement représenté l’émergence d’un clone unique Pendant la saison respiratoire, la résistance aux macrolides a été observée dans les types d’emm, avec une prédominance d’emm. Nous avons trouvé une variabilité géographique considérable dans les taux de résistance aux macrolides dans chaque année d’étude, ainsi que dans l’année. en Finlande, des différences marquées dans les taux de résistance aux macrolides Les variations géographiques et temporelles de la prévalence de la maladie invasive liée au SGA, des séquelles non suppuratives et de l’émergence de types M virulents ou rhumatogènes ont été décrites ailleurs Même dans une communauté semi-fermée, les types M prédominants peut changer rapidement et de manière inattendue Une variation temporelle de la prévalence des types d’emm et de l’hétérogénéité parmi les SGA résistants aux macrolides a été rapportée dans d’autres pays Un facteur contribuant à l’hétérogénéité parmi les GAS macrolides-résistants a été rapporté par Banks et al. qui a démontré l’hétérogénéité dans des parties d’un élément génétique qui comprend le gène mef A Cet élément mef A est un élément d’ADN -kb avec des caractéristiques de prophage ou de prophage compatibles avec la transduction parmi les espèces bactériennes, y compris les types GAS emm Transfert ou absence de transfert de résistance par ce mécanisme contribuerait à l’hétérogénéité de la résistance aux macrolides parmi les pays du GASIn qui ont eu En Finlande, les taux de résistance aux macrolides parmi le SGA ont été associés à la consommation régionale de macrolides au cours des années précédentes arthrose. Cependant, même l’utilisation à très court terme d’azithromycine par des recrues militaires est associée à l’émergence de la résistance aux macrolides chez Streptococcus pneumoniae Nous manquons d’informations sur l’utilisation des macrolides dans les communautés où nos isolats ont été récupérés. L’utilisation de macrolides aux États-Unis a nettement augmenté depuis et a été associée à des taux accrus de résistance aux macrolides. pneumoniae Une résistance généralisée aux macrolides chez les SGA aux États-Unis serait préoccupante. L’utilité actuelle des macrolides pour les patients allergiques à la pénicilline avec une pharyngite à SGA serait compromise. De plus, les enfants atteints de GAZ pharyngien semblent constituer un réservoir important de souches. maladie invasive , donc émergence et locale Les taux élevés de résistance à la clindamycine, associés au génotype erm, auraient un impact significatif sur le traitement de la maladie invasive à SGA, car la clindamycine est souvent recommandée pour le traitement de ces infections possibilité supplémentaire que les souches résistantes aux macrolides, particulièrement les souches erm positives, soient plus invasives que les souches sensibles aux macrolides en raison du lien avec la protéine F liant la fibronectine codée par prtF est intrigante mais non prouvée Il existe des limites possibles à cette étude. en raison de contacts personnels Nous manquons de connaissances détaillées sur les caractéristiques démographiques spécifiques des communautés ou les pratiques médicales à partir desquelles les isolats ont été obtenus. Cependant, les sites sélectionnés sont géographiquement divers et comprennent de nombreuses régions du pays, et les caractéristiques connues des enfants dont les spécimens ont été obtenus sont typique des enfants atteints de pharyngite streptococcique aiguë Les isolats de l’étude ont été recueillis pendant plusieurs périodes à chaque site chaque saison, le nombre d’isolats récupérés au cours de la période est assez élevé, et nos résultats sont conformes aux études d’autres pays. Les taux stables et relativement faibles de résistance aux macrolides et les très faibles taux de résistance à la clindamycine parmi les isolats pharyngés dans cette étude de surveillance multicentrique aux États-Unis sont rassurants. Cependant, nos constatations sont rassurantes. des variations géographiques dans la résistance aux macrolides indiquent que les cliniciens doivent être conscients des taux de résistance locale et doivent considérer la sensibilité lors du traitement avec des macrolides ou de la clindamycine Une surveillance continue est importante pour une meilleure compréhension de l’épidémiologie de la résistance aux macrolides enomenon

Remerciements

Nous remercions Zhongya Li et Varja Sakota au Laboratoire d’épidémiologie moléculaire streptococcique des Centres de contrôle et de prévention des maladies. Nous remercions également les Drs Elizabeth Powell et Sandy Sanguino pour leur aide dans l’analyse statistique. Nous sommes redevables au Dr James Musser d’avoir donné un aperçu de la génétique. Les médecins américains suivants et leurs pratiques ont participé au groupe de surveillance de la pharyngite streptococcique nord-américaine et ont contribué aux isolats utilisés dans cette étude: Dr Richard Nachman Chicago, IL; Dr Edward Rothstein Sellersville, PA; Dr Thomas Zavelson Gainesville, Floride; Catherine Hofer, Chris Tiongson, Rick Kooima et Michael Elliott Sioux Falls, SD; Dr S Michael Marcy et Dr Emily Wong Panorama City, Californie; Dr Jon Almquist Voie fédérale, WA; Dr Del Hodder Bristol, CT; Dr Tracy Stewart et Dr Johnny Ledbetter Little Rock, AR; Dr Paige Suffredini Austin, TX; et Dr Julie Gustin Sandy, UTF soutien financier Biomedical Corporation Bothell, WA, Children’s Memorial Institute pour l’éducation et la recherche Chicago, IL, et National Institutes of Health subvention R AI – conflits d’intérêts potentiels VDS, JB, et SD sont employés d’Abbott Laboratories , et RRT et STS ont reçu un financement de recherche de IDBiomedical Corporation Tous les autres auteurs: aucun conflit